Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms