Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NBPF1Q3BBV0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms