Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM16LQ309B1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM16LQ309B1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM16LQ309B1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM16LQ309B1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM16LQ309B1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM16LQ309B1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM16LQ309B1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM16LQ309B1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM16LQ309B1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM16LQ309B1 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM16LQ309B1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM16LQ309B1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms