Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms