Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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GEN1Q17RS7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
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