Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTN1Q16799 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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RTN1Q16799 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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RTN1Q16799 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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RTN1Q16799 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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RTN1Q16799 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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RTN1Q16799 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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RTN1Q16799 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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RTN1Q16799 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTN1Q16799 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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