Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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