Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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