Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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SSX1Q16384 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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SSX1Q16384 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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SSX1Q16384 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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SSX1Q16384 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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