Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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