Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK4Q16099 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK4Q16099 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK4Q16099 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK4Q16099 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK4Q16099 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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