Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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