Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms