Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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