Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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