Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSME4Q14997 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms