Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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COL19A1Q14993 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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COL19A1Q14993 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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COL19A1Q14993 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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COL19A1Q14993 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL19A1Q14993 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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