Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms