Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCOA4Q13772 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms