Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNA1SQ13698 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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