Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR4Q13639 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR4Q13639 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR4Q13639 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR4Q13639 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR4Q13639 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR4Q13639 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR4Q13639 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTR4Q13639 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms