Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC1Q13547 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC1Q13547 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC1Q13547 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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