Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CHAF1AQ13111 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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CHAF1AQ13111 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CHAF1AQ13111 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CHAF1AQ13111 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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CHAF1AQ13111 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1AQ13111 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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