Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FOXC1Q12948 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FOXC1Q12948 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FOXC1Q12948 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FOXC1Q12948 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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FOXC1Q12948 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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FOXC1Q12948 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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