Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRJQ12913 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.2 ms