Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms