Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FAM27E3Q08E93 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FAM27E3Q08E93 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM27E3Q08E93 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM27E3Q08E93 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM27E3Q08E93 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM27E3Q08E93 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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