Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN1BQ07699 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms