Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAD51Q06609 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD51Q06609 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms