Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC109466.1-206ENST00000522686 774 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 HERC2P4-202ENST00000564145 683 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms