Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms