Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CD164Q04900 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CD164Q04900 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CD164Q04900 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CD164Q04900 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CD164Q04900 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CD164Q04900 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CD164Q04900 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CD164Q04900 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CD164Q04900 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
CD164Q04900 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CD164Q04900 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CD164Q04900 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CD164Q04900 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CD164Q04900 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CD164Q04900 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CD164Q04900 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CD164Q04900 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CD164Q04900 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CD164Q04900 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CD164Q04900 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CD164Q04900 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms