Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF8Q02556 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms