Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms