Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms