Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAT1AQ00266 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MAT1AQ00266 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAT1AQ00266 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAT1AQ00266 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAT1AQ00266 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAT1AQ00266 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAT1AQ00266 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAT1AQ00266 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAT1AQ00266 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAT1AQ00266 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAT1AQ00266 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAT1AQ00266 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms