Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA4P83105 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA4P83105 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms