Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms