Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTG1P63261 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTG1P63261 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms