Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VBP1P61758 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VBP1P61758 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms