Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms