Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms