Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVFC1P60507 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms