Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPD52P55327 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms