Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms