Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPZA1P52907 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPZA1P52907 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPZA1P52907 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPZA1P52907 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPZA1P52907 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPZA1P52907 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA1P52907 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA1P52907 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA1P52907 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA1P52907 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA1P52907 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA1P52907 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA1P52907 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA1P52907 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA1P52907 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA1P52907 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA1P52907 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA1P52907 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA1P52907 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms