Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2A2P52657 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2A2P52657 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms