Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTAP49354 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTAP49354 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTAP49354 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms