Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms