Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms